微流控芯片技术是把生物、化学、医学分析过程的样品制备、反应、分离、检测等基本单元集成到一块微米尺度的芯片上，自动完成分析全过程。
微流控芯片应用十分广泛：
1、在核酸研究中的应用
核酸研究的技术如DNA萃取/纯化、PCR扩增、分子杂交、电泳分离和检测等都可以在微流控芯片上实现。
如今已有的应用包括：基因突变检测、基因分型和DNA测试，就对象而言，病原体的基因检测应用尤为广泛。
2、在蛋白质研究中的应用
（1）、在微流控芯片上的蛋白质样品与处理技术
（2）、蛋白质分离
3、在离子和小分子研究中的应用
（1）、微流控分离
微流控芯片离子分离分析现阶段多以芯片电泳为分离手段，以电化学检测作为主要检测方式。
离子分离模式包括：区带电泳、等速电泳、等速电泳-区带电泳、离子色谱。
（2）、手性分子
a、手性拆分
目前在微流控芯片上有所尝试的拆分方法有：酶法拆分、色谱拆分、电泳法拆分。
其中电泳法是采用最多的一种方法，就拆分方法而言，以直接法居多。
b、手性合成
微流控芯片进行手性合成的研究处于研究阶段，报道较少但前景光明。
c、手性合成-手性拆分集成
手性合成与手性拆分集成使反应和评估系统处于同一量级，具有发展高通量的潜力。
目前已报道的集成模式有游离酶水相反应与区带电泳手性拆分的集成。
4、代谢物
代谢物分析能够帮助人们更好的理解病变过程及机体内物质的代谢途径，在药物开发，疾病诊断与预防等有重要的指导意义。