光学检测法：激光诱导荧光，化学发光和紫外吸收等光学检测器至今仍是主流检测手段。
激光诱导荧光是目前最灵敏的检测方法之一。微流控的主要研究对象核酸、蛋白质、氨基酸等可以通过荧光标记进行检测，因此，激光诱导荧光监测器是一种应用最早，并且至今仍沿用的光学检测器。
其他检测方法还有电化学的检测，质谱检测，光谱检测以及一些基于生物反应器的检测。
