所有基因检测的结果，基因改变与疾病的关系并不能一一对应。并非一定就会发生。同样，即使你检测进去携带耳聋基因，也并不意味一定会出现药毒性耳聋。基因芯片还不能完全取代目前临床实验室诊断，海归的基因检测守业者认为，当前这个阶段应该客观地看待基因芯片技术，但是谁也不能否认它医学参考价值。
谁都想抢一把风气之先，基因芯片的商机不可预估。管它不是萝卜先占个坑，这使得不管是国际还是国内市场都处在一种鱼龙混杂的阶段。目前我国生物芯片企业不少于50家，但获得国家有关部门认证的只有极少数。某些机构把基因检测的销售业务外包出去之后，呈现了一些销售方式上的变味。有的甚至变成了传销。另外，美国的研究小组也在科学杂志发文表示，美国市场上90%基因测试都没有通过正式的管理评估。
而真正的市场化却还远没开始。造成这种现象的原因很复杂，企业在冒进。赵智贤认为，目前基因芯片在药监局的审批难，进入物价收费流程难以及进入医保体系难这三大难题，使得其真正迈入市场化商业之路还很远，而在此之前出现一些市场“乱象”并不难理解。
而且操作复杂、费时，目前的基因芯片价格还是相对高贵。对操作人员的专业素质要求比较高，国内缺乏大量相应的专业基因检测和数据分析人员，这也是推进市场化前要越过的障碍之一。2011年卫生部下发通知，决定将基因芯片诊断技术审批权“下放”省级卫生主管部门。这意味着今后在临床上，将有越来越多的有资质的临床医生使用该项技术。
加速其产业化，如何让基因测试尽早接触市场。各国政府共同的心态。海归的基因检测守业者如此分析国内外形势。这种心态下，先“管”起来，还是先“放”下去，一管一放”力度又该如何把握，并导致不同的行业生态，这对于各国政府都不是一件轻松的事情。
