①双边植入光纤
②单边植入光纤
双边植入光纤“双边植入光纤芯片在制作时，把两根光纤纤芯准确对准并且与沟道垂直比较困难，但它在检测时只需把通过光纤传送的荧光信号经滤光片滤光后与光电倍增管相接即可
单边植入光纤：单边植入光纤芯片的制作过程比较简单，但检测步骤比较繁琐，需要把芯片放在暗盒中并与光电倍增管或者光电二极管紧靠在一起，这样会给操作带来一定的不便。
双边植入光纤
日本的Serge camou等人制作微流控芯片 ：
在玻璃基板上制作好微流控沟道和光纤沟道的模具，然后在模具上浇注PDMS，当PDMS固化后去掉模具，就留下微流控沟道和光纤沟道，把经过处理的两根光纤埋入光纤沟道中，最后把它与另一块玻璃粘合 。
单边植入光纤
单边植入光纤芯片的制作也具有双边植入光纤的几种方法，单边植入的关键之处是检测装置及激发光源的不同。
国哈佛大学的Chabinyc M.L.等人用在模具上浇注PDMS的办法把光纤单边植入到芯片中 。
它的关键之处是：在微流控沟道下端的PDMS中埋入了微型雪崩光电二极管，用来检测荧光信号。
单模光纤的优点：较长的使用寿命、极低的损耗、高质量的信号传输和最大的带宽距离积。但光芯孔径细，不易于对准，波导色散在单模光纤中的影响十分显著。
多模光纤的优点：使用较大的多模光纤纤芯半径，可以很容易地将光功率注入光纤并且易于将相同的光纤连接在一起。