从材料分为有机聚合物芯片（PDMS PMMA PC等）、玻璃芯片、纸芯片和其他芯片
PDMS:聚二甲基硅氧烷
作为一种高分子有机硅化合物，通常被称为有机硅。具有光学透明，且在一般情况下，被认为是惰性，无毒，不易燃。
最广泛使用的硅为基础的有机聚合物材料，其运用包括在生物微机电中的微流道系统、填缝剂、润滑剂、保护剂等
分为A(基本组分)，B(固化剂)两个组分
混合均匀后加热固化
固化后为透明软质材料
优点：惰性，生物相容性，透明，易加工
缺点：软，对蛋白质有吸附作用
PMMA（聚甲基丙烯酸甲酯） PC（聚碳酸酯）俗称有机玻璃，亚克力，透明材料中质地最优异，价格又比较适宜的品种
PMMA树脂是无毒环保的材料，可用于生产餐具，卫生洁具等，具有良好的化学稳定性、和耐候性，在破碎时不易产生尖锐的碎片
PC是几乎无色的玻璃态的无定形聚合物，有很好的光学性。PC高分子量树脂有很高的韧性，主要性能缺陷是耐水解稳定性不够高，对缺口敏感，耐有机化学品性，耐刮痕性较差，长期暴露于紫外线中会发黄。和其他树脂一样，PC容易受某些有机溶剂的浸浊。
原料为透明板材，通道加工有模具热压，机床切割加工等
玻璃:
硼硅酸盐玻璃：以 SiO2和B2O3 为主要成分，具有良好的耐热性和化学稳定性，用以制造烹饪器具、实验室仪器、金属焊封玻璃等。硼酸盐玻璃以 B2O3为主要成分，熔融温度低，可抵抗钠蒸气腐蚀。含稀土元素的硼酸盐玻璃折射率高、色散低，是一种新型光学玻璃。磷酸盐玻璃以 P2O5为主要成分，折射率低、色散低，用于光学仪器中。
石英玻璃：SiO2含量大于99.5%，热膨胀系数低，耐高温，化学稳定性好，透紫外光和红外光，熔制温度高、粘度大，成型较难。多用于半导体、电光源、光导通信、激光等技术和光学仪器中。
钢化玻璃：属于安全玻璃。钢化玻璃其实是一种预应力玻璃，为提高玻璃的强度，通常使用化学或物理的方法，在玻璃表面形成压应力，玻璃承受外力时首先抵消表层应力，从而提高了承载能力，增强玻璃自身抗风压性，寒暑性，冲击性等。
其他微流控芯片：
纸芯片；金属芯片；凝胶芯片等等
